После получения диплома врача выпускник не готов к самостоятельной деятельности. Ему необходимо пройти дополнительную подготовку по специальной образовательно-профессиональной программе. Первым этапом данной программы является первичная специализация, что может быть осуществлено в клинической ординатуре сроком в 2 года по специальности "нефрология". В программе для ординаторов используют их базисные знания и умения (общеврачебные), которые они получили в вузе, и специальные знания, изложенные в учебных планах. Врач должен знать теоретические основы нефрологии, владеть современными достижениями фундаментальных исследований в области физиологии, морфологии почек, генетики, биохимии, фармакологии. Он должен быть ориентирован в смежных специальностях и субспециальностях (терапия, урология, ревматология, эндокринология, акушерство), вопросах организации и экономики здравоохранения, страховой медицины.
Обучение в клинической ординатуре по нефрологии должно проходить на базе крупных клиник или нефрологических центров, где помимо нефрологического отделения имеются отделения гемодиализа, перитонеального диализа, трансплантации почки. Обязательной является работа в поликлиническом отделении клиники или центра. По окончании обучения и сдачи экзамена врач получает сертификат нефролога (приказ Министерства здравоохранения РФ от 19.12.1994 г. № 286).
Данный специалист может быть допущен до работы в нефрологическом кабинете поликлиники, отделении больницы, центрах хронического и острого гемодиализа, перитонеального диализа.
Кроме того, стажированные врачи других специальностей (терапевты, хирурги, реаниматологи), которые работают врачами отделений гемодиализа, должны проходить обучение на циклах общего усовершенствования (переподготовки) по нефрологии по специальной программе, по овладению которой и сдаче экзамена врач получает документ, удостоверяющий прохождение им первичной специализации по нефрологии.