Первичная профилактика идиопатической формы болезни минимальных изменений не разработана. Предупреждение поражения почек у лиц с атопией и аллергическими реакциями возможно при установлении конкретной причины этих реакций (ингаляционные, пищевые аллергены, укусы насекомых, вакцины и др.), при устранении контактов с аллергенами, применении мер по десенсибилизации, соблюдении гипоаллергенной диеты, активной терапии ассоциированных с T-хелперами 2 заболеваний (бронхиальная астма, атопический дерматит). Большое значение имеет установление этиологической связи минимальных изменений клубочков с лимфопролиферативными заболеваниями (лимфомы) и злокачественными солидными опухолями (рак лёгких, почек, кишечника), своевременное их выявление и лечение (хирургическое удаление, химиотерапия).