При своевременной диагностике и правильном лечении острого пиелонефрита прогноз благоприятный, однако нередко перенесённый острый пиелонефрит становится хроническим, который носит характер прогрессирующего заболевания с исходом в ХПН. При правильном лечении и диспансерном наблюдении болезнь прогрессирует медленно, протекает благоприятно. Частые вспышки острого процесса, напротив, делают прогноз в отношении функций почек и жизни менее благоприятным.