НПС относится к числу редких наследственных болезней обмена веществ. Заболевание распространено повсеместно. По данным эпидемиологических обследований, проведенных во Франции, Англии и Германии за период с 1988 по 2002 г., частота НПС составила 0,66-0,83, в Австралии - 0,35-2,20 на 100 000 живых новорожденных. В Голландии с 1970 по 1996 г. было подтверждено 25 случаев НПС, в Португалии с 1985 по 2003 г. - 9 случаев. Истинную частоту НПС оценить довольно сложно в силу сохраняющейся низкой осведомленности врачей об основных клинических проявлениях болезни, а также трудности проведения биохимических и молекулярно-генетических методов тестирования. В дальнейшем, по мере распространения информации о заболевании и более широкого внедрения новых методов диагностики НПС, число выявленных случаев значительно возросло. Во Франции за период с 2000 по 2009 г. было выявлено 63 новых случая НПС, что позволило определить частоту заболевания на уровне 0,82 на 100 000 живых новорожденных. В настоящее время считается, что суммарная частота НПС в мире составляет 1:120 000 - 1:150 000. Высокая частота болезни НПС отмечена среди некоторых генетических изолятов: во французской колонии Акадия (Новая Шотландия), в группах бедуинов в Израиле, испанских поселениях в Колорадо и Нью-Мексико (США), что может быть связано с «эффектом основателя».