В последние годы в ответ на растущий спрос создан целый ряд ресурсов открытого доступа для работы с биологически активными соединениями. Созданы интернет-базы данных низкомолекулярных соединений, их ферментативных реакций и метаболизма. Последние, в частности, используются в качестве полезных инструментов при исследовании свойств пищевых продуктов и лекарств. Такие ресурсы поддерживают поиск информации об отдельных соединениях и способствуют осуществлению вторичного анализа больших наборов данных. Информация может быть получена из БД путем поиска соединения по имени или структуре, представлением с помощью химических кодов или рисования с помощью программного обеспечения для редактирования молекул. Варианты поиска могут быть улучшены путем навигации по сети связей и перекрестных ссылок между ресурсами.
Примеры БД, рассмотренные ниже, относятся к двум классам: инструменты, относящиеся к низкомолекулярным соединениям, и инструменты, аннотирующие ферменты и метаболизм.
Для низкомолекулярных соединений также существует большое разнообразие БД, которые можно подразделить на общие и специализированные ресурсы. Общие содержат информацию о химических соединениях, которые относятся к различным классам и имеют различную биологическую активность и применение. Специализированные содержат информацию о более узких классах соединений, например о пищевых соединениях. БД таких молекул, классифицированные по структуре, биологической активности или применению, указаны в метабазах, таких как OmicTools (http://omictools.com/), LabWorm (https://labworm.com/), MetaComBio (http://www.uwm.edu.pl/metachemibio/index.php/).
Информация, обобщенная в компьютерных БД, может быть использована для прогнозирования метаболизма пищевых компонентов