«Цитокиновый шторм» является следствием особенностей молекулярной биологии коронавируса SARS-CoV-2. Коронавирусы - РНК-вирусы с одноцепочечной РНК (рис. 5), вирион которых содержит особенные спайк-белки (от англ. spike - шип, острие, острый выступ). РНК-вирусы характеризуются высокой степенью мутаций по сравнению с ДНК вирусами (так как вирусные РНК-полимеразы характеризуются низкой степенью исправления ошибок копирования РНК) (San-juan R. et al., 2010). Как следствие, разработка эффективной и безопасной вакцины к SARS-CoV-2 весьма проблематична (Prajapat M. et al., 2020) и может занять длительное время. Высокая степень мутаций коронави-русного генома также обусловливает своего рода «подстроенность» вирусных белков к взаимодействиям с толл-рецепторами.
Размер всего генома коронавируса (рис. 6) (Fung S.Y. et al., 2020) составляет 26-32 тыс. нуклеотидов (для сравнения 25 тыс. нуклеотидов - средняя длина одного гена человека). Заметим, что вирус гриппа А, так же как и COVID-19, является РНК-вирусом с одноцепочечной РНК (последний факт весьма важен для проведения протеомного анализа белков противовирусной защиты, см. далее).
Проведенный в Китае анализ траскриптома (набора всех РНК) в индивидуальных клетках 119 типов, взятых из 13 различных тканей, позволил установить потенциальные молекулы-рецепторы коронавируса SARS-CoV-2. Одним из возможных рецепторов является мембранный
&hide_Cookie=yes)
Рис. 5. Коронавирусы - оболочечные, несегментированные одноцепочечные РНК-вирусы. Вирион включает нуклеокапсид, состоящий из геномной РНК и фосфорилированного белка нуклеокапсида (N), который скрыт внутри фосфолипидных слоев и покрыт спайк-гликопротеином (S). Мембранный (М) белок (трансмембранный гликопротеин типа III) и белок оболочки (Е) расположены среди белков в оболочке вируса