2.1. Систематика и номенклатура микробов
Микробы представлены доклеточными (вирусами - царство Virae) и клеточными (бактериями, архебактериями, грибами и простейшими) формами жизни. Клеточные формы жизни представлены прокариотами (бактериями) , которые не имеют оформленного ядра и организованных органелл, и эукариотами (грибами и простейшими), клетки которых имеют ядро с ядерной оболочкой и ядрышком, а цитоплазма состоит из высокоорганизованных органелл (митохондрии, аппарат Гольджи и др.). Клеточные формы называют микроорганизмами.
Различают следующие таксономические категории микроорганизмов: домен, царство, отдел, класс, порядок, семейство, род, вид, подвид и др. Царства микроорганизмов объединены в три домена (или империи) - Bacteria, Archaea и Eukarya:
— домен Bacteria включает прокариоты, являющиеся настоящими бактериями (эубактериями);
— домен Archaea включает прокариоты, являющиеся археями, или архебактериями;
— домен Eukarya включает царства Protozoa (простейших), Eumycota (настоящих грибов) и Chromista (хромовиков) - новое царство, образованное в результате реклассификации некоторых простейших и грибов из более раннего устаревшего таксона - царства грибов (Fungi, Mycota).
Одна из основных таксономических категорий - вид (species), т.е. совокупность особей, объединенных по близким свойствам, но отличающихся от других представителей рода.
Совокупность однородных микроорганизмов, выделенных на питательной среде, характеризуемых сходными морфологическими, тинкториальными (отношением к красителям) и другими свойствами, называется чистой культурой. Чистая культура микроорганизмов, выделенных из определенного источника и отличающихся от других представителей вида, называется штаммом. Близким к понятию штамма является понятие клона.
Для обозначения некоторых совокупностей микроорганизмов, отличающихся по тем или иным свойствам, употребляется суффикс -var- (разновидность) вместо ранее применяемого -type-. Именно поэтому микроорганизмы в зависимости от характера различий обозначают как морфовары (отличие по морфологии), резистентовары (отличие по устойчивости, например, к антибиотикам), серовары (отличие по антигенам), фаговары (отличие по чувствительности к бактериофагам), биовары (отличие по биологическим свойствам) и т. д.