Глоссарий

Агрегация

Процесс образования скоплений клеток (лат. aggregatio - присоединение)

Адгезия

Способность микроорганизмов адсорбироваться на твердых поверхностях и клетках (лат. adhaesio - прилипание)

АЗЩЖ

Аутоиммунные заболевания щитовидной железы

Анастомоз

Созданное оперативным путем сообщение между сосудами, органами или полостями

Ангиогенез

Процесс образования новых кровеносных сосудов в органе или ткани

Антагонизм

Тип несимбиотических взаимоотношений, при котором один организм полностью подавляет или замедляет рост другого

Антибиотик-ассоциированная диарея

Диарея на фоне применения антибиотиков или в течение 4-8 нед после их отмены при отсутствии других причин

Антибиотикорезистентность

Устойчивость возбудителей инфекций к антимикробным препаратам

анти-PD-1/PD-L1

Моноклональные антитела, ингибиторы контрольных точек в иммунотерапии рака

АРТ

Антиретровирусная терапия ВИЧ

Археом

Набор генов микроорганизмов из домена археи в определенной локализации

АЧН

Абсолютное число нейтрофилов (подвид гранулоци-тарных лейкоцитов)

БАД

Биологически активная добавка

Бактериоцин

Продуцируемые бактериями белки и пептиды с антимикробной активностью

БГ

Бета-глюкан, самый распространенный полисахарид клеточной стенки грибов

Биодоступность

Количество неизмененного вещества, которое достигло плазмы крови, относительно введенной исходной дозы препарата

Билиарная экскреция

Выведение лекарственных средств и их метаболитов с желчью

Биомаркер

Биологический показатель, который используется в качестве индикатора состояния организма или системы

Биопленки

Особая форма взаимодействия микроорганизмов с формированием устойчивого сообщества для повышения устойчивости к факторам внешней среды

Биоразнообразие

Разнообразие организмов и их сочетаний

Биосенсор

Аналитический прибор, в котором для определения химических соединений используются реакции, проходящие в органеллах, клетках или тканях

Биотоп

Относительно однородный по факторам среды участок пространства, занятый определенным сообществом

Биотрансформация

Комплекс физико-химических и биохимических превращений чужеродных веществ в организме (метаболизм)

БЛРС

β-лактамазы расширенного спектра, группа ферментов бактерий, определяющих устойчивость к β-лактамным антибиотикам

ВАП

Вентилятор-ассоциированная пневмония - пневмония, связанная с искусственной вентиляцией легких

Васкуляризация

Формирование новых кровеносных сосудов внутри ткани

ВЗК

Воспалительные заболевания кишечника, язвенный колит и болезнь Крона

Виром

Набор генов вирусов в определенной локализации

Вирулентность

Мера патогенности, индивидуально присущая конкретному штамму патогенного возбудителя

ВПГ

Вирус простого герпеса

ВРТ

Вспомогательные репродуктивные технологии - методы, направленные на достижение беременности, при которых отдельные или все этапы зачатия осуществляются вне организма будущей матери

Гомеостаз

Саморегуляция, способность открытой системы сохранять постоянство своего внутреннего состояния

Гранулоциты

Наиболее многочисленная подгруппа лейкоцитов крови

ГСК

Гемопоэтические стволовые клетки - предшественники клеток крови, которые дают начало всем остальным клеткам крови

ДНК

Дезоксирибонуклеиновая кислота - макромолекула, обеспечивающая хранение, передачу из поколения в поколение и реализацию генетической программы живых организмов

Западный тип диеты

Употребление в пищу большого количества красного мяса, полуфабрикатов и обработанных продуктов с высоким содержанием жиров и сахаров

ИВЛ

Искусственная вентиляция легких

ИЛ

Интерлейкины, группа цитокинов

Иммуноонкология

Раздел медицины, изучающий функции иммунной системы при онкологических заболеваниях

Иммуносупрессия

Угнетение иммунитета при заболеваниях или применении иммуносупрессивных препаратов и методов воздействия

Иммунотерапия рака

Использование возможностей иммунных клеток для уничтожения клеток-мишеней опухоли

Инвазия

Заражение живых организмов паразитами животной природы

Интервальное голодание

Тип питания, в котором регулируются временные циклы с приемом пищи и без него

Интерфероны

Белки, обладающие противовирусным и иммуномо-дулирующим действием

Инфекция

Проникновение патогенного возбудителя в другой, более высокоорганизованный растительный или животный организм и последующее их антагонистическое взаимоотношение

ИТК

Ингибиторы тирозинкиназы, противоопухолевые препараты

ИСМП

Инфекции, связанные с оказанием медицинской помощи (прежний термин - внутрибольничные инфекции)

КДАИ

Clostridioides difficile-ассоциированная инфекция в диапазоне проявлений от диареи до псевдомембра-нозного колита, токсического мегаколона и септического шока

Кембрийский взрыв

Условное название явления, результатом которого стало резкое увеличение количества ископаемых остатков живых существ в отложениях, соответствующих началу кембрийского периода (взрыв скелетной фауны)

Кетогенная диета

Низкоуглеводная диета с высоким содержанием жиров и умеренным содержанием белков

Когнитивные функции

Познавательные функции головного мозга, с помощью которых осуществляются процессы восприятия, обработки и анализа, запоминания, хранения и обмена информацией

Когорта

В клинической эпидемиологии - выборка индивидуумов, которые имеют общую определяющую характеристику

Колонизация

Присутствие микроорганизма в организме хозяина с наличием роста и размножения, но без патологического взаимодействия между хозяином и микроорганизмом, при отсутствии клинических проявлений

Комменсализм

Форма симбиоза, при которой один из партнеров системы (комменсал) возлагает на другого (хозяин) регуляцию своих отношений с внешней средой

Комменсальные штаммы

Представители нормальной микробиоты в нормальных условиях, в том числе обеспечивающие устойчивость к патогенным микроорганизмам

Кондиционирование

Подготовка пациента с помощью цитостатической (химио- и лучевой) терапии к трансплантации гемо-поэтических стволовых клеток

Конъюгация

Однонаправленный перенос части генетического материала (плазмид или бактериальной хромосомы) при непосредственном контакте двух бактериальных клеток

Ксенобиотики

Чужеродные для живых организмов химические вещества, в естественных условиях не входящие в циклы биохимических процессов

КСФ

Колониестимулирующие факторы - гликопротеины, которые вызывают пролиферацию и дифференци-ровку клеток-предшественников в определенный тип клеток крови

Культуральный метод

Метод, основанный на выделении культуры микроорганизмов на питательных средах (бактериологический метод)

Лаборатория на чипе

Миниатюрный прибор, позволяющий осуществлять один или несколько многостадийных химических процессов на одном чипе площадью от нескольких квадратных миллиметров до нескольких квадратных сантиметров

Лиганд

Химическое соединение, которое образует комплекс с клеточным рецептором и производит вследствие такого связывания биохимические, физиологические или фармакологические эффекты

ЛПВП

Липопротеины высокой плотности - класс липопро-теинов плазмы крови, снижающих риск атеросклероза и сердечно-сосудистых заболеваний

ЛПНП

Липопротеины низкой плотности - класс липопро-теинов крови, повышающих риск атеросклероза

ЛПС

Липополисахарид - основной компонент клеточной стенки грамотрицательных бактерий (эндотоксин), способный взаимодействовать с клетками организма человека и стимулировать синтез физиологически активных веществ

ЛСБ

Липополисахарид-связывающий белок - секрети-руемый белок в острой фазе воспаления, который связывается с бактериальным ЛПС и обеспечивает иммунный ответ

ЛС

Лекарственное средство

Мальабсорбция

Потеря одного или многих питательных веществ, поступающих в пищеварительный тракт, обусловленная недостаточностью их всасывания в тонкой кишке

Мальдигестия

Комплекс симптомов, причиной которых является недостаточное переваривание пищевых веществ в желудочно-кишечном тракте

Менопауза

Окончательное прекращение менструальных циклов у женщин

Метаанализ

Объединение результатов нескольких исследований методами статистики для идентификации значимых закономерностей

Метаболиты

Продукты метаболизма (биотрансформации) каких-либо соединений

Метаболомика

Исследование микробных и человеческих метаболитов

Метагеномика

Определение состава генов представителей микро-биоты

Метатаксономика

Глубокая таксономическая характеристика микробиоты

Микобиом

Набор генов грибов в определенной локализации

Микробиом

Набор микроорганизмов, их генов и факторов среды определенной локализации

Микробиота

Набор микроорганизмов определенной локализации

Микробиотоп

Площадь или субстрат для деятельности микробиоты в макроорганизме

Микробный коктейль

Комплексный препарат, содержащий ряд жизнеспособных защитных бактерий в составе микробиом-ассоциированной терапии нового поколения

Микробы

Микроорганизмы, собирательное название живых организмов, которые слишком малы для того, чтобы быть видимыми невооруженным глазом

Микроэкология

Наука о взаимоотношениях микроорганизмов друг с другом и с окружающей средой

Микст-инфекция

Заболевание, вызванное одновременно несколькими видами микроорганизмов

Митотический индекс

Мера количественного анализа интенсивности деления клеток

Моноинфекция

Заболевание, вызванное одним видом микроорганизмов

МСК

Мезенхимальные стволовые клетки, популяция муль-типотентных клеток-предшественников, способных трансформироваться в различные типы зрелых клеток, включая жировые, костные, хрящевые, мышечные и нервные

Мукозит

Воспаление слизистой оболочки рта, глотки, пищевода и других отделов желудочно-кишечного тракта как осложнение химиотерапии

Мутуализм

Один из типов симбиоза, широко распространенная форма взаимовыгодного сожительства, когда присутствие партнера становится обязательным условием существования каждого из них

Нейромодуляторы

Биологически активные вещества, которые напрямую не изменяют состояние синаптических мембран, но влияют на интенсивность и продолжительность действия нейротрансмиттеров и таким образом влияют на активность синаптической передачи сигнала

Нейротрансмиттеры

Биологически активные вещества, посредством которых осуществляется передача электрохимического импульса от нервной клетки через синаптическое пространство между нейронами, а также от нейронов к мышечной ткани или железистым клеткам (нейромедиаторы)

Неонатальный период

Период от момента рождения и до 28 полных дней жизни

НЖБП

Неалкогольная жировая болезнь печени, спектр клинико-морфологических изменений печени, представленных стеатозом, стеатогепатитом, фиброзом и циррозом, развивающихся у пациентов, не употребляющих алкоголь в гепатотоксичных дозах

НПВС

Нестероидные противовоспалительные средства

Нутриенты

Составные элементы продуктов питания, используемые организмом для формирования, обновления и полноценного функционирования органов, тканей, клеток

НЭАП

Низкоэтерифицированный амидированный пектин, пищевая добавка

Облигатные анаэробы

Организмы, живущие и растущие только при отсутствии молекулярного кислорода в среде

ОИТР

Отделение интенсивной терапии и реанимации

Омикс-технологии

Собирательное название для современных технологий в молекулярной биологии, включая геномику, эпигеномику, протеомику, липидомику, гликомику, метаболомику, транскриптомику и др.

Оперон

Функциональная единица генома у прокариот, в состав которой входят гены, кодирующие совместно или последовательно работающие белки

ОТЕ

Операционная таксономическая единица, кластерное объединение результатов секвенирования определенного гена микроорганизмов с 97% идентичностью, суррогатный таксономический уровень

ПАМС

Патоген-ассоциированные молекулярные структуры, молекулярные структуры, присущие всем патогенным микроорганизмам, распознаваемые белками иммунной системы человека

Паразитизм

Форма антагонистических взаимоотношений двух различных организмов, при которой один из них (паразит) использует другого (хозяина) в качестве среды обитания или источника пищи

Патобионт

Потенциально патогенный (болезнетворный) в особых условиях микроорганизм, который при нормальных обстоятельствах является обычным представителем резидентной микробиоты (синоним - условный патоген)

Патогенез

Механизм появления и развития заболевания, а также отдельных его проявлений

Патогенность

Видовой признак микроорганизма, закрепленный генетически и характеризующий способность вызывать заболевание

Патогены

Микроорганизмы, обладающие факторами патоген-ности и вызывающие заболевание при попадании в организм человека

Пейсмейкер

Водитель ритма, клетка или группа клеток возбудимой ткани, способные генерировать ритмичные импульсы возбуждения, которые распространяются на другие клетки

Пероральное введение

Прием препарата внутрь, через рот, путем проглатывания

Персонификация медицины

Модель медицины, основанная на том, что медицинские решения, подходы, вмешательства и/или препараты подбираются индивидуально для каждого пациента на основе заранее прогнозируемой эффективности или риска

Плазмида

Небольшая кольцевая молекула ДНК, физически обособленная от хромосом и способная к автономной репликации, может передаваться от одной бактерии к другой, являясь средством горизонтального переноса генов

Популяция

Совокупность организмов одного вида, длительное время обитающих на одной территории и частично или полностью изолированных от особей других таких же групп

Портальная гипертензия

Синдром повышенного давления в системе воротной вены, вызванного нарушением кровотока в портальных сосудах, печеночных венах и нижней полой вене

Постнатальный период

Внеутробный период развития, от момента рождения до смерти

Пребиотик

Вещества, которые приводят к специфическим изменениям в составе и/или функциях микробиоты, направленным на пользу здоровью человека

Пренатальный период

Внутриутробный период развития, до момента рождения

Пробиотик

Препараты живых микроорганизмов, которые направлены на пользу здоровью организма человека при использовании в адекватных количествах

Прокариоты

Одноклеточные живые микроорганизмы, не обладающие оформленным клеточным ядром (доядерные)

Пролиферация

Разрастание ткани организма путем размножения клеток делением

Протеомика

Одновременное изучение многих белков в определенной локализации

Псевдомембранозный колит

Одна из клинических форм Clostridioides difficile-ассоциированной инфекции

ПЦР

Полимеразная цепная реакция, метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определенных фрагментов ДНК в биоматериале

РАС

Расстройства аутистического спектра, расстройства психического развития, характеризующиеся стойким дефицитом способности поддерживать социальное взаимодействие, а также ограниченными интересами и стереотипами поведения

Реабсорбция

Обратное всасывание жидкости из полостей и полых анатомических структур организма

Реинфекция

Повторное заболевание, развивающееся в результате нового заражения тем же возбудителем

рРНК

Рибосомальные рибонуклеиновые кислоты, а именно молекулы РНК, составляющие основу рибосомы, важнейшей немембранной органеллы всех живых клеток, служащей для биосинтеза белка из аминокислот на основе генетической информации

РТПХ

Реакция «трансплантат против хозяина», опасное осложнение аллогенной ТГСК, при котором стволовые клетки донора воспринимают реципиента как чужеродный объект и атакуют ткани его организма

Секвенирование

Определение нуклеотидной или аминокислотной последовательности (лат. sequentum - последовательность)

Селективный прессинг

Влияние какого-либо фактора среды (например, антибиотика) на естественный отбор для преимущества одной группы организмов над другой

Сенесцентные клетки

Стареющие клетки, неспособные к делению, с частичной функциональностью и отрицательным влиянием на микросреду путем выделения медиаторов воспаления

Синапс

Место контакта между двумя нейронами или между нейроном и получающей сигнал клеткой, служит для передачи нервного импульса

Синбиотик

Комбинированные препараты, имеющие в своем составе как пробиотики (микроорганизмы), так и пре-биотики (вещества)

Симбиоз

Форма взаимоотношений между организмами разных видов, при которой хотя бы один из них получает для себя пользу

Систематический обзор

Научное изучение отобранных однородных оригинальных исследований с целью их критического анализа и получения ответа на объединяющий их вопрос

Скрининг

Система первичного обследования объемных групп с целью выявления определенных индивидуумов

Социомикробиология

Наука, направленная на изучение того, как микроорганизмы взаимодействуют и функционируют в составе сложных сообществ

Спейсерная ДНК

Участки некодирующей ДНК, расположенные между тандемно повторяющимися генами, например генами рРНК у эукариот

Споры

Покоящиеся формы жизненного цикла бактерий, образующиеся в неблагоприятных условиях существования

СРК

Синдром раздраженного кишечника, функциональное заболевание кишечника

Стереоизомеры

Пространственные изомеры, химические соединения, имеющие одинаковое строение, но отличающиеся пространственным расположением атомов

Таксономия

Совокупность принципов и правил классификации объектов

Таксон

Группа организмов, связанных той или иной степенью родства и достаточно обособленная, чтобы ей можно было присвоить таксономическую категорию того или иного ранга

Танатомикробиом

Набор генов микроорганизмов, принадлежащий телу хозяина после его смерти

ТГСК

Трансплантация гемопоэтических стволовых клеток, медицинская процедура, применяемая в гематологии и онкологии при заболеваниях крови и костного мозга, а также иных злокачественных заболеваниях

Токсигенность

Способность микроорганизмов к выработке и выделению токсинов (экзо- и эндотоксины)

Токсический мегаколон

Одно из осложнений C. difficile -ассоциированной инфекции, характеризуется атонией и расширением толстой кишки

Трансдукция

Процесс горизонтального переноса бактериальной ДНК из одной клетки в другую бактериофагом

Транслокация

Проникновение жизнеспособных микроорганизмов из желудочно-кишечного тракта в другие участки организма

Трансформация

Процесс горизонтального переноса бактериальной ДНК, при котором ДНК проходит через промежуточную среду, а ее поглощение зависит от бактерии-реципиента

ТФМ

Трансплантация фекальной микробиоты, процесс трансплантации кишечных микроорганизмов реципиенту, страдающему тем или иным заболеванием

УДФ

Уридиндифосфат

Уропатогены

Возбудители инфекций мочевыделительной системы

Условные патогены

См. Патобионт

Факультативные анаэробы

Организмы, энергетические циклы которых проходят по анаэробному пути, но которые способны существовать при доступе кислорода

Фармакогенетика

Раздел науки о генетических основах вариабельности эффектов лекарственных средств, позволяющих прогнозировать их эффективность и безопасность

Фармакодинамика

Раздел фармакологии, изучающий локализацию, механизм действия и биологические эффекты лекарственных средств, силу и длительность их воздействия

Фармакокинетика

Раздел фармакологии о всасывании, распределении в организме, депонировании, метаболизме и выведении веществ

Фебрильная нейтропения

Собирательный инфекционный синдром у пациентов, получающих иммуносупрессивную терапию, заключающийся в наличии однократной лихорадки выше 38,3 °С или лихорадки выше 38,0 °С на протяжении не менее 1 ч в сочетании с АЧН<500 кл/мкл или при высокой вероятности снижения АЧН ниже 500 кл/мкл в течение следующих 48 ч

ФНО-альфа

Фактор некроза опухоли-альфа (англ. tumor necrosis factor, TNF), провоспалительный цитокин

ФРК

Функциональные расстройства кишечника, группа гетерогенных клинических состояний, которые проявляются симптомами со стороны среднего и нижнего отделов желудочно-кишечного тракта

Хемокины

Большое семейство структурно схожих цитокинов, которые стимулируют передвижение лейкоцитов и регулируют их миграцию из крови в ткани

Хромосома прокариот

Хромосома у бактерий, архей в форме молекулы кольцевой ДНК, в отличие от линейной хромосомы большинства эукариот

Цитокины

Небольшие пептидные информационные молекулы, которые регулируют межклеточные и межсистемные взаимодействия, определяют выживаемость клеток, стимуляцию или подавление их роста, дифференциацию, функциональную активность и апоптоз

Чувство кворума

Способность микроорганизмов общаться и координировать свое поведение за счет секреции молекулярных сигналов

Штамм

Низкоуровневый таксономический ранг, используется на уровне внутривидовых различий микроорганизмов

Экзогенная инфекция

Инфекция, вызываемая вследствие проникновения возбудителя извне

Экология

Наука о взаимодействиях живых организмов между собой и с их средой обитания

Экосистема

Биологическая система, состоящая из сообщества живых организмов (биоценоз), среды их обитания (биотоп), системы связей, осуществляющей обмен веществ и энергии между ними

Эндогенная инфекция

Инфекция, вызываемая представителем собственной резидентной микробиоты, приобретающая значение самостоятельной формы заболевания

Эндоэкология

Наука об экологии внутренней среды организма

ЭНС

Энтеральная нервная система, часть нервной системы, регулирующая работу гладких мышц внутренних органов

Энтеротип

Микробные пейзажи, ассоциированные с определенными пищевыми стереотипами

Энцефалопатия

Синдром распространенного невоспалительного поражения головного мозга вследствие нарушений питания и энергетического обмена, обусловленных рядом заболеваний

Этиология

Причины и условия возникновения заболеваний

Эукариоты

Домен живых организмов, клетки которых содержат ядро

BDNF

Мозговой нейротрофический фактор (англ. brain-derived neurotrophic factor) представителей семейства нейротрофинов, медиатор выживания и восстановления нейронов

CD

Кластер дифференцировки, номенклатура диффе-ренцировочных антигенов лейкоцитов человека, как правило, поверхностных мембранных белков

CDC

Центр по контролю и профилактике заболеваний США, федеральный орган по противодействию и профилактике заболеваний

CRISPR-CAS9

Новая технология редактирования геномов высших организмов, основанная на использовании иммунной системы бактерий

CTLA4

Белковый рецептор, который функционирует как иммунная контрольная точка, используется в иммунотерапии рака

FDA

Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США, регулирующий и контролирующий государственный орган в области здравоохранения

FISH

Флуоресцентная гибридизация in situ (англ. fluorescence in situ hybridization), цитогенетический метод исследования

FODMAP

Собирательный термин в нутрициологии для обозначения короткоцепочечных углеводов (олигоса-харидов, дисахаридов, моносахаридов и близких по строению сахароспиртов - полиолов), которые не полностью всасываются в тонком кишечнике человека, их содержание в рационе человека контролируется в определенных типах диет

GALT

Лимфоидная ткань, ассоциированная с желудочно-кишечным трактом (англ. gut-associated lymphoid tissue)

HLA-система

Человеческие лейкоцитарные антигены, или система тканевой совместимости человека (англ. human leukocyte antigens), группа антигенов тканевой совместимости у людей

In vivo

Проведение экспериментов на (или внутри) живой ткани при живом организме, тестирование на животных и клинические испытания являются формами исследования in vivo

In vitro

Технология выполнения экспериментов, когда опыты проводятся в пробирке, вне живого организма, на культуре живых клеток или в бесклеточной модели

In silico

Компьютерное моделирование (симуляция) эксперимента

ITS

Регион ДНК, используемый в качестве универсального генетического грибкового штрих-кода для оценки состава микобиома (англ. internal transcribed spacer)

LGS

Синдромом повышенной проницаемости кишечника (англ. leaky gut syndrome)

l-антибиотик

Класс полициклических пептидных природных антибиотиков, продуцируемых бактериями, в том числе в составе микробиоты

MODY-диабет

Сахарный диабет взрослого типа у молодых (англ. maturity onset diabetes of the young), несколько схожих по протеканию форм диабета с аутосомно-доми-нантным типом наследования

MRSA

Метициллинрезистентный золотистый стафилококк, устойчивый к ряду антибиотиков, распространенный возбудитель инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи

NK-клетки

Тип цитотоксических лимфоцитов, участвующий в функционировании врожденного иммунитета (англ. natural killer cells)

NMDA-рецепторы

Рецептор глутамата, селективно связывающий N-метил-D-аспартат, играет ключевую роль в синап-тической пластичности и процессах обучения и памяти

NOD-рецепторы

Класс цитоплазматических клеточных рецепторов, относящихся к образ-распознающим рецепторам, играют важную роль во врожденном иммунитете

Reuptake

Реабсорбция нейротрансмиттера после того, как он выполнил свою функцию передачи нервного импульса

TLR-рецепторы

Толл-подобные рецепторы, класс клеточных рецепторов, которые распознают патоген-ассоциированные молекулярные структуры (ПАМС) микроорганизмов и активируют иммунный ответ (англ. toll-like receptor)

VEGF

Фактор роста эндотелия сосудов, сигнальный белок, вырабатываемый клетками для стимулирования ангио-генеза (англ. vascular endothelial growth factor)

VRE

Ванкомицинрезистентный энтерококк, штаммы бактерий рода Enterococcus, устойчивый к антибиотику ванкомицину